Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChkaO54804 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ChkaO54804 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChkaO54804 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChkaO54804 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ChkaO54804 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChkaO54804 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChkaO54804 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChkaO54804 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChkaO54804 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChkaO54804 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChkaO54804 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkaO54804 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkaO54804 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms