Protein–RNA interactions for Protein: O54799

Nmbr, Neuromedin-B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbrO54799 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NmbrO54799 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NmbrO54799 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NmbrO54799 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NmbrO54799 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NmbrO54799 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NmbrO54799 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbrO54799 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbrO54799 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbrO54799 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbrO54799 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbrO54799 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbrO54799 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbrO54799 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbrO54799 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbrO54799 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbrO54799 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbrO54799 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbrO54799 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbrO54799 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbrO54799 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbrO54799 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbrO54799 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbrO54799 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbrO54799 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbrO54799 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbrO54799 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbrO54799 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbrO54799 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbrO54799 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbrO54799 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbrO54799 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbrO54799 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbrO54799 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmbrO54799 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmbrO54799 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NmbrO54799 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmbrO54799 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmbrO54799 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms