Protein–RNA interactions for Protein: O54781

Srpk2, SRSF protein kinase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk2O54781 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srpk2O54781 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms