Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms