Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek2O35942 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek2O35942 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek2O35942 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms