Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1baO35930 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1baO35930 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1baO35930 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1baO35930 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1baO35930 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1baO35930 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1baO35930 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1baO35930 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1baO35930 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1baO35930 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1baO35930 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1baO35930 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1baO35930 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gp1baO35930 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gp1baO35930 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gp1baO35930 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gp1baO35930 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gp1baO35930 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gp1baO35930 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gp1baO35930 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gp1baO35930 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gp1baO35930 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gp1baO35930 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gp1baO35930 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gp1baO35930 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gp1baO35930 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gp1baO35930 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gp1baO35930 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gp1baO35930 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gp1baO35930 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gp1baO35930 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gp1baO35930 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1baO35930 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms