Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 AC162940.1-201ENSMUST00000224745 1167 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Gm6113-201ENSMUST00000180319 639 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Lilrb4a-205ENSMUST00000217705 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx8O35652 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms