Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stag2O35638 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag2O35638 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag2O35638 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stag2O35638 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stag2O35638 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag2O35638 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag2O35638 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag2O35638 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms