Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms