Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt1O35449 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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