Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kpna3O35344 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms