Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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