Protein–RNA interactions for Protein: O35310

Hs3st1, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st1O35310 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hs3st1O35310 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms