Protein–RNA interactions for Protein: O35125

Lrrc23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc23O35125 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc23O35125 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms