Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ArxO35085 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ArxO35085 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ArxO35085 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ArxO35085 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ArxO35085 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ArxO35085 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ArxO35085 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ArxO35085 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ArxO35085 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ArxO35085 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ArxO35085 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ArxO35085 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ArxO35085 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ArxO35085 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ArxO35085 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ArxO35085 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ArxO35085 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ArxO35085 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ArxO35085 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ArxO35085 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ArxO35085 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ArxO35085 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ArxO35085 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ArxO35085 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ArxO35085 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ArxO35085 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ArxO35085 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ArxO35085 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ArxO35085 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ArxO35085 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ArxO35085 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ArxO35085 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ArxO35085 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ArxO35085 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ArxO35085 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ArxO35085 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ArxO35085 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ArxO35085 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ArxO35085 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ArxO35085 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ArxO35085 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ArxO35085 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ArxO35085 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ArxO35085 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ArxO35085 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ArxO35085 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ArxO35085 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ArxO35085 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ArxO35085 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ArxO35085 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ArxO35085 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ArxO35085 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ArxO35085 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ArxO35085 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ArxO35085 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ArxO35085 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ArxO35085 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ArxO35085 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ArxO35085 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ArxO35085 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ArxO35085 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ArxO35085 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ArxO35085 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ArxO35085 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ArxO35085 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ArxO35085 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ArxO35085 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ArxO35085 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ArxO35085 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ArxO35085 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ArxO35085 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ArxO35085 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ArxO35085 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ArxO35085 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ArxO35085 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ArxO35085 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ArxO35085 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ArxO35085 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ArxO35085 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ArxO35085 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ArxO35085 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ArxO35085 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ArxO35085 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ArxO35085 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ArxO35085 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ArxO35085 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ArxO35085 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ArxO35085 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ArxO35085 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ArxO35085 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ArxO35085 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ArxO35085 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ArxO35085 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ArxO35085 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ArxO35085 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ArxO35085 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ArxO35085 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ArxO35085 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ArxO35085 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms