Protein–RNA interactions for Protein: O35071

Kif1c, Kinesin-like protein KIF1C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif1cO35071 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms