Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Snap23O09044 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Snap23O09044 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snap23O09044 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snap23O09044 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Snap23O09044 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Snap23O09044 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snap23O09044 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snap23O09044 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snap23O09044 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snap23O09044 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snap23O09044 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snap23O09044 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snap23O09044 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Snap23O09044 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap23O09044 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap23O09044 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap23O09044 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snap23O09044 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snap23O09044 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Snap23O09044 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snap23O09044 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap23O09044 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap23O09044 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap23O09044 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap23O09044 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap23O09044 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap23O09044 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms