Protein–RNA interactions for Protein: O08976

Pbsn, Probasin, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbsnO08976 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PbsnO08976 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PbsnO08976 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PbsnO08976 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PbsnO08976 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PbsnO08976 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PbsnO08976 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PbsnO08976 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PbsnO08976 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PbsnO08976 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PbsnO08976 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PbsnO08976 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PbsnO08976 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PbsnO08976 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms