Protein–RNA interactions for Protein: O08583

Alyref, THO complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlyrefO08583 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms