Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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