Protein–RNA interactions for Protein: M0QW51

Gm17078, Predicted gene 17078, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17078M0QW51 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm17078M0QW51 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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