Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2035J3QP87 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms