Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mfsd4b4J3QNS5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mfsd4b4J3QNS5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mfsd4b4J3QNS5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Mfsd4b4J3QNS5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mfsd4b4J3QNS5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mfsd4b4J3QNS5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Mfsd4b4J3QNS5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mfsd4b4J3QNS5 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mfsd4b4J3QNS5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mfsd4b4J3QNS5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mfsd4b4J3QNS5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mfsd4b4J3QNS5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mfsd4b4J3QNS5 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mfsd4b4J3QNS5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mfsd4b4J3QNS5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mfsd4b4J3QNS5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mfsd4b4J3QNS5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mfsd4b4J3QNS5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mfsd4b4J3QNS5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mfsd4b4J3QNS5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mfsd4b4J3QNS5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mfsd4b4J3QNS5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mfsd4b4J3QNS5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mfsd4b4J3QNS5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mfsd4b4J3QNS5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mfsd4b4J3QNS5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mfsd4b4J3QNS5 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mfsd4b4J3QNS5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mfsd4b4J3QNS5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mfsd4b4J3QNS5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mfsd4b4J3QNS5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mfsd4b4J3QNS5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mfsd4b4J3QNS5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mfsd4b4J3QNS5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mfsd4b4J3QNS5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mfsd4b4J3QNS5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Mfsd4b4J3QNS5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mfsd4b4J3QNS5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mfsd4b4J3QNS5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms