Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms