Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gm20918J3QN17 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Gm20918J3QN17 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Gm20918J3QN17 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Gm20918J3QN17 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20918J3QN17 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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