Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm20830J3KML6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm20830J3KML6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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