Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pabpc4lG5E8X2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms