Protein–RNA interactions for Protein: G3X9I7

Zc3h12b, MCG2522, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12bG3X9I7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h12bG3X9I7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms