Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms