Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms