Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK8

Pcdh9, Protocadherin 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh9F8VPK8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms