Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M1F7CXU4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M1F7CXU4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M1F7CXU4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M1F7CXU4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M1F7CXU4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M1F7CXU4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M1F7CXU4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M1F7CXU4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M1F7CXU4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M1F7CXU4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-M1F7CXU4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms