Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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