Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms