Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms