Protein–RNA interactions for Protein: F6V035

Ccdc149, Coiled-coil domain-containing 149, mousemouse

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Length 524 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc149F6V035 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ccdc149F6V035 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Ccdc149F6V035 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ccdc149F6V035 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ccdc149F6V035 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ccdc149F6V035 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc149F6V035 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ccdc149F6V035 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ccdc149F6V035 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc149F6V035 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc149F6V035 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ccdc149F6V035 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ccdc149F6V035 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc149F6V035 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ccdc149F6V035 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc149F6V035 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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