Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms