Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ccdc7bE9Q9Y3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ccdc7bE9Q9Y3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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