Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd7E9Q9W7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms