Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms