Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9D8

Ankrd35, Ankyrin repeat domain 35, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd35E9Q9D8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd35E9Q9D8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms