Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8Q6

Ccdc141, Coiled-coil domain-containing 141, mousemouse

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc141E9Q8Q6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc141E9Q8Q6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc141E9Q8Q6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc141E9Q8Q6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc141E9Q8Q6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc141E9Q8Q6 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc141E9Q8Q6 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc141E9Q8Q6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc141E9Q8Q6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc141E9Q8Q6 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc141E9Q8Q6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc141E9Q8Q6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc141E9Q8Q6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc141E9Q8Q6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc141E9Q8Q6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc141E9Q8Q6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc141E9Q8Q6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc141E9Q8Q6 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc141E9Q8Q6 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc141E9Q8Q6 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc141E9Q8Q6 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc141E9Q8Q6 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc141E9Q8Q6 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc141E9Q8Q6 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc141E9Q8Q6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc141E9Q8Q6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc141E9Q8Q6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc141E9Q8Q6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms