Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip11E9Q512 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms