Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3P4

Cenpf, Centromere protein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpfE9Q3P4 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CenpfE9Q3P4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CenpfE9Q3P4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms