Protein–RNA interactions for Protein: E9Q257

Gm8237, Predicted gene 8237, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8237E9Q257 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8237E9Q257 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8237E9Q257 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8237E9Q257 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8237E9Q257 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8237E9Q257 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8237E9Q257 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8237E9Q257 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8237E9Q257 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8237E9Q257 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8237E9Q257 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8237E9Q257 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8237E9Q257 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm8237E9Q257 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm8237E9Q257 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm8237E9Q257 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm8237E9Q257 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm8237E9Q257 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm8237E9Q257 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm8237E9Q257 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8237E9Q257 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms