Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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