Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms