Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms