Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ryr1E9PZQ0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms