Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brd1E9PZ26 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Brd1E9PZ26 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Brd1E9PZ26 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brd1E9PZ26 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brd1E9PZ26 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brd1E9PZ26 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brd1E9PZ26 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brd1E9PZ26 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms